Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms