Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pard3bQ9CSB4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pard3bQ9CSB4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pard3bQ9CSB4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pard3bQ9CSB4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pard3bQ9CSB4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pard3bQ9CSB4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pard3bQ9CSB4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pard3bQ9CSB4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms