Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CR55 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CR55 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CR55 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CR55 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CR55 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CR55 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CR55 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CR55 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CR55 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CR55 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CR55 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CR55 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CR55 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CR55 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CR55 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CR55 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CR55 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CR55 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CR55 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CR55 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CR55 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CR55 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CR55 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CR55 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CR55 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CR55 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CR55 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CR55 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CR55 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CR55 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CR55 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CR55 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CR55 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CR55 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CR55 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CR55 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9CR55 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CR55 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CR55 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CR55 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CR55 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CR55 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CR55 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CR55 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CR55 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CR55 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CR55 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CR55 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CR55 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CR55 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CR55 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CR55 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CR55 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CR55 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CR55 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CR55 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CR55 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CR55 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CR55 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CR55 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CR55 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CR55 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CR55 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CR55 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CR55 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CR55 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CR55 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CR55 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CR55 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q9CR55 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CR55 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CR55 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CR55 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CR55 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CR55 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CR55 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CR55 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CR55 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CR55 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CR55 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CR55 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CR55 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CR55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CR55 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CR55 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CR55 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CR55 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CR55 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CR55 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CR55 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CR55 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CR55 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CR55 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CR55 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CR55 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CR55 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CR55 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CR55 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CR55 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms