Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc43Q9CR29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc43Q9CR29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc43Q9CR29 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc43Q9CR29 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc43Q9CR29 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms