Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg12Q9CQY1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atg12Q9CQY1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg12Q9CQY1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms