Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim8Q9CQQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim8Q9CQQ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms