Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpb2Q9CQI7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpb2Q9CQI7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpb2Q9CQI7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpb2Q9CQI7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms