Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufb5Q9CQH3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufb5Q9CQH3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufb5Q9CQH3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb5Q9CQH3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms