Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chmp3Q9CQ10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chmp3Q9CQ10 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chmp3Q9CQ10 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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