Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b1Q99NB9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b1Q99NB9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b1Q99NB9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b1Q99NB9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms