Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brms1Q99N20 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Brms1Q99N20 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brms1Q99N20 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Brms1Q99N20 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms