Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR9

Ppp1r3a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3aQ99MR9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3aQ99MR9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp1r3aQ99MR9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r3aQ99MR9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r3aQ99MR9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r3aQ99MR9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r3aQ99MR9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r3aQ99MR9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r3aQ99MR9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r3aQ99MR9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r3aQ99MR9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms