Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mccc1Q99MR8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mccc1Q99MR8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mccc1Q99MR8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mccc1Q99MR8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mccc1Q99MR8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mccc1Q99MR8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mccc1Q99MR8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mccc1Q99MR8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mccc1Q99MR8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mccc1Q99MR8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mccc1Q99MR8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms