Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PtprtQ99M80 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
PtprtQ99M80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PtprtQ99M80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PtprtQ99M80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PtprtQ99M80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
PtprtQ99M80 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PtprtQ99M80 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
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