Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cmtm3Q99LJ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms