Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sh3bp5lQ99LH9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5lQ99LH9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp5lQ99LH9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bp5lQ99LH9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp5lQ99LH9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms