Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dok4Q99KE3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dok4Q99KE3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dok4Q99KE3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dok4Q99KE3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dok4Q99KE3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms