Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf11Q99JX1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf11Q99JX1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf11Q99JX1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf11Q99JX1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf11Q99JX1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf11Q99JX1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf11Q99JX1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf11Q99JX1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf11Q99JX1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf11Q99JX1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf11Q99JX1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms