Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SptssbQ925E8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SptssbQ925E8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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