Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn1Q922Y1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn1Q922Y1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn1Q922Y1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn1Q922Y1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms