Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EedQ921E6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EedQ921E6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EedQ921E6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EedQ921E6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EedQ921E6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EedQ921E6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EedQ921E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EedQ921E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EedQ921E6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EedQ921E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EedQ921E6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EedQ921E6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EedQ921E6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EedQ921E6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EedQ921E6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms