Protein–RNA interactions for Protein: Q920R0

Als2, Alsin, mousemouse

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2Q920R0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Als2Q920R0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Als2Q920R0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Als2Q920R0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Als2Q920R0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Als2Q920R0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Als2Q920R0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Als2Q920R0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Als2Q920R0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Als2Q920R0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Als2Q920R0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Als2Q920R0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Als2Q920R0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Als2Q920R0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Als2Q920R0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms