Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf3Q920N1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf3Q920N1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms