Protein–RNA interactions for Protein: Q920M7

Syt17, Synaptotagmin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt17Q920M7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syt17Q920M7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Syt17Q920M7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syt17Q920M7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Syt17Q920M7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syt17Q920M7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syt17Q920M7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syt17Q920M7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syt17Q920M7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt17Q920M7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt17Q920M7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt17Q920M7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt17Q920M7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syt17Q920M7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syt17Q920M7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syt17Q920M7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syt17Q920M7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syt17Q920M7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syt17Q920M7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syt17Q920M7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syt17Q920M7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syt17Q920M7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syt17Q920M7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syt17Q920M7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syt17Q920M7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syt17Q920M7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms