Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx4Q91YJ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx4Q91YJ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx4Q91YJ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms