Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tm4sf4Q91XD3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tm4sf4Q91XD3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tm4sf4Q91XD3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tm4sf4Q91XD3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tm4sf4Q91XD3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tm4sf4Q91XD3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms