Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkal1Q91WE6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkal1Q91WE6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkal1Q91WE6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkal1Q91WE6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms