Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE4

UPF0729 protein C18orf32 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WE4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q91WE4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q91WE4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q91WE4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q91WE4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q91WE4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q91WE4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q91WE4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q91WE4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q91WE4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q91WE4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q91WE4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q91WE4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q91WE4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q91WE4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q91WE4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q91WE4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q91WE4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q91WE4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q91WE4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q91WE4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q91WE4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q91WE4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q91WE4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q91WE4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q91WE4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q91WE4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q91WE4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q91WE4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q91WE4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q91WE4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q91WE4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q91WE4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q91WE4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q91WE4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q91WE4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q91WE4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q91WE4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q91WE4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q91WE4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q91WE4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q91WE4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q91WE4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q91WE4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q91WE4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q91WE4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q91WE4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q91WE4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q91WE4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q91WE4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q91WE4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q91WE4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WE4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WE4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WE4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WE4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WE4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WE4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WE4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WE4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WE4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WE4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WE4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WE4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WE4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WE4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WE4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q91WE4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q91WE4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WE4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WE4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WE4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WE4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WE4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WE4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WE4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WE4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WE4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WE4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WE4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WE4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WE4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WE4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WE4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WE4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WE4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WE4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WE4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WE4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WE4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WE4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WE4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WE4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WE4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WE4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WE4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WE4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WE4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Q91WE4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms