Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tdrd3Q91W18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd3Q91W18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tdrd3Q91W18 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tdrd3Q91W18 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tdrd3Q91W18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tdrd3Q91W18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms