Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE5

Pcdhb10, Protocadherin beta 10, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb10Q91VE5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb10Q91VE5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb10Q91VE5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb10Q91VE5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb10Q91VE5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 580.9 ms