Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx18Q8VDS8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx18Q8VDS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx18Q8VDS8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx18Q8VDS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx18Q8VDS8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx18Q8VDS8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms