Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cep57l1Q8VDS7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep57l1Q8VDS7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cep57l1Q8VDS7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cep57l1Q8VDS7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cep57l1Q8VDS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms