Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med17Q8VCD5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Med17Q8VCD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Med17Q8VCD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Med17Q8VCD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms