Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slf1Q8R3P9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf1Q8R3P9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf1Q8R3P9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slf1Q8R3P9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slf1Q8R3P9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slf1Q8R3P9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slf1Q8R3P9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slf1Q8R3P9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms