Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk8Q8R3L8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk8Q8R3L8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk8Q8R3L8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk8Q8R3L8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk8Q8R3L8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk8Q8R3L8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk8Q8R3L8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk8Q8R3L8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk8Q8R3L8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk8Q8R3L8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdk8Q8R3L8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms