Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps37cQ8R105 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps37cQ8R105 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps37cQ8R105 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps37cQ8R105 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37cQ8R105 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms