Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cdk5rap2Q8K389 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cdk5rap2Q8K389 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cdk5rap2Q8K389 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms