Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssh3Q8K330 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh3Q8K330 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssh3Q8K330 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh3Q8K330 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms