Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf13Q8K2W6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf13Q8K2W6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf13Q8K2W6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf13Q8K2W6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms