Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms