Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pms1Q8K119 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pms1Q8K119 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pms1Q8K119 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pms1Q8K119 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pms1Q8K119 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pms1Q8K119 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pms1Q8K119 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pms1Q8K119 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms