Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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Tbc1d23Q8K0F1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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Tbc1d23Q8K0F1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tbc1d23Q8K0F1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d23Q8K0F1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
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Tbc1d23Q8K0F1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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Tbc1d23Q8K0F1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tbc1d23Q8K0F1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tbc1d23Q8K0F1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tbc1d23Q8K0F1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tbc1d23Q8K0F1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d23Q8K0F1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tbc1d23Q8K0F1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tbc1d23Q8K0F1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tbc1d23Q8K0F1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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Tbc1d23Q8K0F1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
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Tbc1d23Q8K0F1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
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Tbc1d23Q8K0F1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
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Tbc1d23Q8K0F1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tbc1d23Q8K0F1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d23Q8K0F1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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