Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a11Q8K0E3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a11Q8K0E3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a11Q8K0E3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a11Q8K0E3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a11Q8K0E3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a11Q8K0E3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a11Q8K0E3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a11Q8K0E3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a11Q8K0E3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a11Q8K0E3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a11Q8K0E3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a11Q8K0E3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a11Q8K0E3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a11Q8K0E3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms