Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syn3Q8JZP2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syn3Q8JZP2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syn3Q8JZP2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syn3Q8JZP2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syn3Q8JZP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syn3Q8JZP2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syn3Q8JZP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms