Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp27Q8CEG8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp27Q8CEG8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp27Q8CEG8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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