Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrrc9Q8CDN9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrrc9Q8CDN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrrc9Q8CDN9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lrrc9Q8CDN9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms