Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RybpQ8CCI5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RybpQ8CCI5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RybpQ8CCI5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RybpQ8CCI5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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