Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms