Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms