Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf12Q8C8K3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf12Q8C8K3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf12Q8C8K3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms